Prof. Dr. EBRU TOKSOY ÖNER


Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü

Biyomühendislik Anabilim Dalı


WoS Araştırma Alanları: Mühendislik Bilişim Ve Teknoloji (Eng), Mühendislik Çok Disiplinli, Mühendislik Biyomedikal, Yaşam Bilimleri (Life)


Avesis Araştırma Alanları: Biyomedikal Mühendisliği, Kimya Mühendisliği ve Teknolojisi, Biyoteknoloji, Mühendislik ve Teknoloji


Yayınlardaki İsimler: TOKSOY ÖNER EBRU, Toksoy E, Oener Ebru Toksoy, Oner Ebru Toksoy

Metrikler

Yayın

205

Yayın (WoS)

139

Yayın (Scopus)

134

Atıf (WoS)

1878

H-İndeks (WoS)

25

Atıf (Scopus)

2980

H-İndeks (Scopus)

32

Atıf (Scholar)

344

H-İndeks (Scholar)

10

Atıf (Diğer Toplam)

1

Proje

15

Fikri Mülkiyet

1

Tez Danışmanlığı

23

Açık Erişim

22
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Biyografi

Professor Ebru Toksoy Öner received her PhD degree in Chemical Engineering in the year 2000 and currently she is working as a Professor at the Bioengineering Department of Marmara University (Istanbul, Turkey). She is the Principal Investigator of the Industrial Biotechnology and Systems Biology (IBSB). Prof. Toksoy Öner’s current research in IBSB focuses on biomaterials, functional foods and systems microbiology. Ongoing research topics are functional biosurfaces, laser-based technologies, extremophiles, fructans, levan polysaccharide, strain improvement for exopolysaccharide production, production of biopolymers form extremophiles, and optimization of fermentation processes to design high-yield production lines.

Prof. Toksoy Öner has been the coordinator of several national and international projects and partner in COST Actions. She is the Member of European Federation of Biotechnology (EFB), American Nano Society (ANS), American Chemical Society (ACS), International Society for Extremophiles (ISE), Turkish Biotechnology Society and author of various book chapters, reviews and more than 80 peer-reviewed research articles.

Eğitim Bilgileri

1995 - 2000

1995 - 2000

Doktora

Boğaziçi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

1993 - 1995

1993 - 1995

Yüksek Lisans

Boğaziçi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

1988 - 1993

1988 - 1993

Lisans

Boğaziçi Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü, Türkiye

Yaptığı Tezler

2000

2000

Doktora

Production of Taq I Restriction and Modification Enzymes by Using Two Different Expression Systems

Boğaziçi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü

1995

1995

Yüksek Lisans

Cloning and Purification of a Thermostable DNA Polymerase

Boğaziçi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü

Yabancı Diller

C2 Ustalık

C2 Ustalık

İngilizce

Araştırma Alanları

Biyomedikal Mühendisliği

Kimya Mühendisliği ve Teknolojisi

Biyoteknoloji

Mühendislik ve Teknoloji

Akademik Ünvanlar / Görevler

2013 - Devam Ediyor

2013 - Devam Ediyor

Prof. Dr.

Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü

2008 - 2013

2008 - 2013

Doç. Dr.

Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü

2007 - 2008

2007 - 2008

Yrd. Doç. Dr.

Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü

2001 - 2007

2001 - 2007

Yrd. Doç. Dr.

Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü

1993 - 2000

1993 - 2000

Araştırma Görevlisi

Boğaziçi Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü

Yönetimsel Görevler

2014 - Devam Ediyor

2014 - Devam Ediyor

Enstitü Müdür Yardımcısı

Marmara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü

2002 - 2003

2002 - 2003

Anabilim/Bilim Dalı Başkanı

Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü

Yönetilen Tezler

2019

2019

Yüksek Lisans

3d printed levan scaffolds for cardiac regeneration

TOKSOY ÖNER E. (Eş Danışman), GÜNDÜZ O. (Eş Danışman)

E.Eminagic(Öğrenci) Creative Commons License

2017

2017

Doktora

Levan-encapsulated magnetıc nanocomposıtes

TOKSOY ÖNER E. (Danışman)

İ.Çalgeriş(Öğrenci) Creative Commons License

2014

2014

Yüksek Lisans

Bioactivity of levan based surfaces

TOKSOY ÖNER E. (Danışman)

M.Erginer(Öğrenci) Creative Commons License

2010

2010

Yüksek Lisans

Identification of levansucrase gene in Halomonas sp.

TOKSOY ÖNER E. (Danışman)

B.Gökmen(Öğrenci) Creative Commons License

Makaleler

Tümü (120)
SCI-E, SSCI, AHCI (112)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (115)
ESCI (3)
Scopus (116)
TRDizin (2)
Diğer Yayınlar (1)

Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

2022

2022

2. Microbial and Enzymatic Production of Halomonas Levan

KIRTEL O., KASAVİ C., TOKSOY ÖNER E.

IX. International Fructan Symposium, İstanbul, Türkiye, 10 Ekim 2022, (Özet Bildiri)

2018

2018

4. Levan based Bioadhesives for Biomedical Applications

TOKSOY ÖNER E.

ICBBA 2018, 20 - 22 Kasım 2018, (Tam Metin Bildiri)

2018

2018

5. Genome-scale metabolic model reconstruction of Brevibacillus thermoruber 423

YAŞAR YILDIZ S., NİKEREL İ. E., TOKSOY ÖNER E.

12th Internatonal Congress of Extremophiles, İtalya, 16 - 20 Eylül 2018, (Tam Metin Bildiri)

2017

2017

6. Fructosyltransferases of the saline world

TOKSOY ÖNER E.

Biotechnologia Habana 2017, 3 - 06 Aralık 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

7. Metabolic Capacities of Lactic Acid Bacteria in Cheese Starter Cultures Grown in Pure and Co-Cultures

ÖZCAN E., NİKEREL İ. E., ÇAKIR T., TOKSOY ÖNER E.

12th International Symposium on Lactic Acid Bacteria, Hollanda, 27 - 31 Ağustos 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

8. Tailor Made Heteropolysaccharide Biosynthesis by Brevibacillus thermoruber 423

YAŞAR YILDIZ S., NİKEREL İ. E., TOKSOY ÖNER E.

19th European Carbohydrate Symposium EUROCARB, 2 - 06 Temmuz 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

9. Halomonas Levan as a Bioactive and Biocompatible Material

Erginer M., Selvi S., AVŞAR G., TOKSOY ÖNER E.

19th European Carbohydrate Symposium EUROCARB, 2 - 06 Temmuz 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

10. Halomonas Levan: A functional food ingredient

TOKSOY ÖNER E., Erginer M., Kırtel O., AVŞAR G., ÖZER Ç.

19th European Carbohydrate Symposium EUROCARB, 2 - 06 Temmuz 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

11. Development of Low-Cost Microbial Bioprocesses for Halomonas Levan Production

Erkorkmaz B., Kırtel O., TOKSOY ÖNER E.

19th European Carbohydrate Symposium EUROCARB, 2 - 06 Temmuz 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

13. An Alternative Nano Design Strategy by Neutralized AMPS and Soy Bean Lecithin to Form Nanoparticles

MUTLU E., SENNAROĞLU BOSTAN M., BAHADORİ F., TOKSOY ÖNER E., EROĞLU M. S.

19th International Conference on Nanotechnology and Nanomedicine, Vien, Avusturya, 21 - 22 Haziran 2017, cilt.4, (Tam Metin Bildiri)

2017

2017

14. Development of Halomonas Levan based functional food ingredients

HASKÖYLÜ M., ÖZER Ç., TOKSOY ÖNER E.

FFC's 21st International Conference and Expo on Functional FoodsFunctional Foods and Bioactive Compounds in Health and Disease: Science and Practice, San Diego, Amerika Birleşik Devletleri, 26 - 27 Mart 2017, (Özet Bildiri)

2016

2016

15. Coproduction of Pha and Levan from waste resources byhalophilic Bacteria

Thome S., CAN Z. S., TOKSOY ÖNER E.

The 3rd International Conference on Bioinspired and Biobased Chemistry & Materials, 16 - 19 Ekim 2016, (Özet Bildiri)

2016

2016

16. Levan Nanofibers as Functional Biomaterials

Avşar G., GÜNDÜZ O., TOKSOY ÖNER E.

NICE 2016, 16 - 19 Ekim 2016, (Özet Bildiri)

2016

2016

17. Coproduction of PHA Levan from Waste Resources by Halophilic Bacteria

Tohme S., CAN Z. S., TOKSOY ÖNER E.

NICE (Nature Inspires Creativity Engineers) 2016, Fransa, 16 - 19 Ekim 2016, (Özet Bildiri)

2016

2016

21. Metabolic network-based analysis of probiotic cheese starter cultures

Ozcan E., Oner E. T., Cakir T.

41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Türkiye, 3 - 08 Eylül 2016, cilt.283, ss.138, (Özet Bildiri) identifier

2016

2016

22. Sulfated levan as a polymer for biomedical applications

Avsar G., GÜNDÜZ O., TOKSOY ÖNER E.

8th INTERNATIONAL FRUCTAN SYMPOSIUM, 26 Haziran - 01 Temmuz 2016 identifier identifier identifier

2016

2016

23. In silico analysis of anticoagulant activity of levan sulfate via molecular docking simulations

Coşkunkan B., Morova T., Rende D., Bucak S., Baysal N., Ozışık R., et al.

IFS2016 – 8th International Fructan Symposium, 26 Haziran - 01 Temmuz 2016, (Özet Bildiri)

2016

2016

25. Levan Sulfate as a Heparin mimetic Bioactive Fructan

erginer m., EROĞLU M. S., AĞIRBAŞLI M. A., TOKSOY ÖNER E.

8th INTERNATIONAL FRUCTAN SYMPOSIUM, 26 Haziran - 01 Temmuz 2016, (Özet Bildiri)

2016

2016

26. Dual Production of PHA and Levan From Waste Resources by Halomonas Cultures

Tohme S., CAN Z. S., TOKSOY ÖNER E.

8th INTERNATIONAL FRUCTAN SYMPOSIUM, 26 Haziran - 01 Temmuz 2016, (Özet Bildiri)

2016

2016

27. Sulfated levan nanofibers for biomedical applications

Avşar G., GÜNDÜZ O., TOKSOY ÖNER E.

IFS2016 – 8th International Fructan Symposium, 26 Haziran - 01 Temmuz 2016, (Özet Bildiri)

2016

2016

28. Cost effective levan production by Halomonas cultures

Erkorkmaz B., TOKSOY ÖNER E.

IFS2016 – 8th International Fructan Symposium, 26 Haziran - 01 Temmuz 2016, (Özet Bildiri)

2016

2016

29. Levansucrase enzyme from moderately halophilic bacterium Halomonas smyrnensis AAD6T

Kırtel O., TOKSOY ÖNER E.

IFS2016 - 8th Int. Fructan Symposium, Oaxaca, Meksika, 26 Haziran - 01 Temmuz 2016, (Özet Bildiri)

2015

2015

32. Levan sulphate as a heparin mimetic bioactive polysaccharide

Erginer M., TOKSOY ÖNER E.

ESBP15- 8th European Symposium on Biopolymers, 16 - 18 Eylül 2015

2015

2015

34. Low cost microbial production processes for levan biopolymer

Erkorkmaz B. A., ATEŞ Ö., TOKSOY ÖNER E.

ESBP15- 8th European Symposium on Biopolymers, 16 - 18 Eylül 2015

2015

2015

35. Development of Microbial production processes for levan polysaccharide

ATEŞ Ö., TOKSOY ÖNER E.

CBM11 - 11th Carbohydrate Bioengineering Meeting, 10 - 13 Mayıs 2015

2015

2015

37. Functional ferrofluids based on levan coated magnetite nanopartices

Gaziyer V., Cebeci C. B., Morova T., ATEŞ Ö., TOKSOY ÖNER E., GENÇ S.

Nanotech International Conference and Exhibition, Hammamet, Tunus, 22 - 24 Nisan 2015, (Özet Bildiri)

2015

2015

38. Functional Ferrofluids Based on Levan Coated Magnetic Nanoparticles

Gaziyer V., Cebeci C., Morova T., ATEŞ Ö., TOKSOY ÖNER E., GENÇ S.

Nanotech Tunisia 2015 International Conference, 22 - 24 Nisan 2015, (Özet Bildiri)

2013

2013

39. Investigation of Transcriptional Response to Ethanol Stress in Saccharomyces cerevisiae

KASAVİ C., ERASLAN S., TOKSOY ÖNER E., KIRDAR B.

2nd Applied Synthetic Biology in Europe, Malaga, İspanya, 25 - 27 Kasım 2013, (Özet Bildiri)

2013

2013

40. Surface characterization of chitosan POE levan ternary blend films

SENNAROĞLU BOSTAN M., MUTLU E., KAZAK H., KESKİN S. S., TOKSOY ÖNER E., EROĞLU M. S.

The 4th International Symposium on Surface and Interface of Biomaterials, 24 - 28 Eylül 2013, (Özet Bildiri)

2013

2013

42. A novel levansucrase purified from halophilic bacteria halomonas smyrnensis AAD6T

TURANLI B., ARĞA K. Y., TOKSOY ÖNER E.

10th Carbohydrate Bioengineering Meeting (CBM10), Prague, Çek Cumhuriyeti, 21 - 24 Nisan 2013, (Özet Bildiri)

2012

2012

43. Investigation of the Response to Ethanol Stress in Saccharomyces cerevisiae

KASAVİ C., TOKSOY ÖNER E., KIRDAR B.

Microbial Stress: from Molecules to Systems (second meeting organized by European Federation of Biotechnology Section on Microbial Physiology), Belgirate, İtalya, 10 - 13 Mayıs 2012, (Özet Bildiri)

2011

2011

44. Genomic Comparison of Ethanol Tolerance Genes of Industrial Saccharomyces cerevisiae Strains

KASAVİ C., TOKSOY ÖNER E., KIRDAR B.

EMBO (European Molecular Biology Organization) Conference on Comparative Genomics of Eukaryotic Microorganisms: Understanding the Complexity of Diversity, San Feliu de Guixols, İspanya, 15 - 20 Ekim 2011, (Özet Bildiri)

2011

2011

45. Systems Based Modular Approach to Analyze Ethanol Tolerance in Saccharomyces cerevisiae

KASAVİ C., TOKSOY ÖNER E., KIRDAR B.

12th International Conference on Systems Biology, Mannheim, Almanya, 28 Ağustos - 01 Eylül 2011, (Özet Bildiri)

2010

2010

46. Genomic Comparison of Ethanol Tolerances of Industrial Saccharomyces cerevisiae Strains

KIRDAR B., KASAVİ C., TOKSOY ÖNER E.

11th International Conference on Systems Biology, Edinburgh, Saint Helena, 10 - 15 Ekim 2010, (Özet Bildiri)

2010

2010

47. LEVAN PRODUCTION BY Halomonas sp.

Kazak H., Ates O., Kucukasik F., ARĞA K. Y., Oner E. T.

6th International Conference on Polysaccharides-Glycoscience, Prague, Çek Cumhuriyeti, 29 Eylül - 01 Ekim 2010, ss.133-134, (Tam Metin Bildiri) identifier

2010

2010

49. Ekstremofil kaynaklı ekzopolisakkaritlerin biyoflokülant özellikleri

ŞAM S., Küçükaşık F., YENİGÜN O., TOKSOY ÖNER E., YÜKSELEN M. A.

12. EndüstriyelKirlenme Kontrolü Sempozyumu, İstanbul, Türkiye, 16 - 18 Haziran 2010

2009

2009

50. Fermentation Performances of Industrial Yeast Strains in Second Generation Bioethanol Production

KASAVİ C., Finore I., Nicolaus B., TOKSOY ÖNER E., KIRDAR B., Oliver S. G.

International Symposium on Biotechnology: Developments and Trends, Ankara, Türkiye, 27 - 30 Eylül 2009, (Özet Bildiri)

2008

2008

51. New natural materials

Özyeğin L. S., OKTAR F. N., SALMAN S., GÜNDÜZ O., TOKSOY ÖNER E., Tüyel U.

14th International Biomedical Science and Technology Symposium, 11 - 13 Mayıs 2008, (Özet Bildiri) identifier identifier identifier

2007

2007

52. Exopolysaccharide production by Halomonas strains isolated from Turkey

Kazak H., Gurleyendag B., Poli A., Oner E. T., Nicolaus B.

13th European Congress on Biotechnology (ECB 13), Barcelona, İspanya, 16 - 19 Eylül 2007, cilt.131, (Özet Bildiri) identifier

2007

2007

53. Effect of bioprocess conditions on growth and alkaline protease production by halotolerant Bacillus licheniformis BA17

Nikerel I. E., Ates O., TOKSOY ÖNER E.

13th European Congress on Biotechnology (ECB 13), Barcelona, İspanya, 16 - 19 Eylül 2007, cilt.131, (Özet Bildiri) identifier

2007

2007

54. Construction of amylolytic nuclear petite Saccharomyces cerevisiae strains for bioethanol production by SSF

Arslan D., Ates O., Oner E. T., Oliver S. G., Kirdar B.

13th European Congress on Biotechnology (ECB 13), Barcelona, İspanya, 16 - 19 Eylül 2007, cilt.131, (Özet Bildiri) identifier

2007

2007

55. Production and characterization of bioceramic nanopowders of natural-biological origin

Tuyel U., Oner E. T., Ozyegin S., Oktar F. N.

13th European Congress on Biotechnology (ECB 13), Barcelona, İspanya, 16 - 19 Eylül 2007, cilt.131, (Özet Bildiri) identifier

Kitaplar

2017

2017

1. Microbial Polysaccharides as Food Ingredients

AVŞAR DEMET G., TOKSOY ÖNER E., KIRTEL O., ERKORKMAZ B. A.

Microbial Production of Food Ingredients and Additives, , Editör, Academic Press , ss.347-383, 2017

2017

2017

2. Glycan-based Nanocarriers In Drug Delivery

YAŞAR YILDIZ S., ERGİNER HASKÖYLÜ M., DEMİRCİ T., HEMBERGER J., TOKSOY ÖNER E.

Drug Delivery Approaches And Nanosystems, A. K SHARMA R. K. KESERVANI, Editör, Apple Academic Press, ss.191-228, 2017

2015

2015

3. Exopolysaccharides from Prokaryotic Microorganisms-Promising Sources for White Biotechnology

Kambourova M., TOKSOY ÖNER E., Poli A.

Industrial Biorefineries and White Biotechnology, A. Pandey, R. Höfer, M. Taherzadeh, K. M. Nampoothiri and C Larroche, Editör, Elsevier B.V., ss.523-547, 2015

2015

2015

4. Investigating the Quorum Sensing System in Halophilic Bacteria

Tommonaro G., Abbamonti R., TOKSOY ÖNER E., Nicolaus B.

Halophiles, Dinesh K. Maheshwari ve Meenu Saraf, Editör, Springer Int., ss.189-208, 2015

2015

2015

5. Microbial Production of Extracellular Polysaccharides from Biomass Sources

ÖZCAN E., TOKSOY ÖNER E.

Polysaccharides, Kishan Gopal Ramawat ve Jean-Michel Merillon, Editör, Springer Int., ss.161-184, 2015

Desteklenen Projeler

2018 - 2020

2018 - 2020

Farklı Biyosorbentler ile Sucul Ortamlardan Bisfenol A Giderimi

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

Hacıosmanoğlu G. G., Can Z. S. (Yürütücü), Genç S., Toksoy Öner E.

2012 - 2016

2012 - 2016

Yeni nesil biyoyakıt teknolojileri için ekstremofiller

TÜBİTAK Uluslararası İkili İşbirliği Projesi , 2504 - İtalya Ulusal Araştırma Konseyi (CNR) İkili İşbirliği Programı

Arğa K. Y., Toksoy Öner E. (Yürütücü)

2011 - 2015

2011 - 2015

Levan bazlı polimerlerin biyolojik aktivitelerinin in vitro ve in silico incelenmesi

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Arğa K. Y., Toksoy Öner E. (Yürütücü)

2012 - 2014

2012 - 2014

Levan Bazlı Polimerlerin Biyolojik Aktivitelerinin In Vitro ve In Silico İncelenmesi

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Arğa K. Y., Toksoy Öner E. (Yürütücü)

2009 - 2011

2009 - 2011

Bioethanol - A Source of Renewable Energy from ExtremophilesSürdürülebilir Kalkınma

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Toksoy Öner E. (Yürütücü)

2008 - 2010

2008 - 2010

Yeni bir mikrobiyal biyopolimerin endüstriyel uygulama alanlarının araştırılması

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Sezer A. D., Toksoy Öner E. (Yürütücü), Akbuğa J., Kazak H.

2007 - 2010

2007 - 2010

Yüksek Verimli Biyo-Yakıt Üretimi İçin Sistem Bazlı in-silico Model Geliştirilmesi ve Fabrika Hücrelerin Akılcı Tasarımı

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Toksoy Öner E., Kirdar B.(Yürütücü)


Atıflar

Toplam Atıf Sayısı (WOS): 1765

h-indeksi (WOS): 25