Metrikler
Yayın
102
Açık Erişim
11
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Biyografi
Dr. Berna Sarıyar Akbulut, 1973 yılında İstanbul'da doğdu. 1995 yılında Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümü’nde lisans eğitimini tamamladıktan sonra, aynı yıl lisansüstü çalışmalarına yine Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümü’nde başladı. 1997 yılında yüksek lisans ve 2003 yılında doktorasını tamamladı. 2003 yılında TUBITAK desteği ile Berlin’de Humboldt Üniversitesi’nde doktora sonrası çalışmalarını sürdürdü. Aynı yıl Marmara Üniversitesi Mühendislik Fakültesi'ne Yardımcı Doçent olarak katılan Akbulut, 2011 yılında doçent, 2016 yılında da profesör unvanını aldı.
Metabolik mühendislik, protein mühendisliği ve antimiktobiyel mekanizmaların anlaşılması konularında çalışmakta olan Akbulut danışmanlığında çok sayıda yüksek lisans ve doktora tezi tamamlanmıştır.
Eğitim Bilgileri
1995 - 1997
1995 - 1997Yüksek Lisans
Boğaziçi Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü, Türkiye
1991 - 1995
1991 - 1995Lisans
Boğaziçi Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü, Türkiye
Yaptığı Tezler
2003
2003Doktora
Experimental and theoretical studies of protein translocation by the sec pathway
Boğaziçi Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü
1997
1997Yüksek Lisans
Cloning of thermostable glucose isomerase of thermus thermophilus in escherichia coli
Boğaziçi Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü
Yabancı Diller
C1 İleri
C1 İleriİngilizce
A2 Temel
A2 TemelAlmanca
Araştırma Alanları
Mühendislik ve Teknoloji
Akademik Ünvanlar / Görevler
2003 - Devam Ediyor
2003 - Devam EdiyorProf. Dr.
Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü
Yönetilen Tezler
2019
2019Yüksek Lisans
Çoklu İlaç Dirençliliği Sağlayan Dışa Atım Pompalarının İnhibisyonları Üzerine Hesapsal Çalışma
Sarıyar Akbulut B.
D.ŞENTÜRK(Öğrenci)
2019
2019Yüksek Lisans
Computational study on the inhibition multidrug resistance efflux pumps
SARIYAR AKBULUT B. (Eş Danışman), ÖZBEK SARICA P. (Eş Danışman)
D.Şentürk(Öğrenci)
2019
2019Yüksek Lisans
Biotransformation studies with Curvularia lunata
Sarıyar Akbulut B. (Danışman), SAYAR N. A.
D.YILMAZ(Öğrenci)
2019
2019Yüksek Lisans
Evaluation of thymol and carvacrol as efflux pumps inhibitors in staphylococcus aureus
SARIYAR AKBULUT B. (Danışman)
C.Selin(Öğrenci)
2018
2018Doktora
Investigation of aporphine alkaloids for their antimicrobial activities
Sarıyar Akbulut B. (Danışman)
F.GİZEM(Öğrenci)
2017
2017Yüksek Lisans
Understanding alkaliphilic adaptation of Bacillus marmarensis sp. nov. using omic tools
Sarıyar Akbulut B. (Danışman)
F.ECE(Öğrenci)
2016
2016Yüksek Lisans
Bacterial uptake of antimicrobial peptides
SARIYAR AKBULUT B. (Danışman)
D.IRVALI(Öğrenci)
2016
2016Yüksek Lisans
Drug design against antimicrobial resistance
SARIYAR AKBULUT B. (Danışman)
K.BETÜL(Öğrenci)
2016
2016Yüksek Lisans
Transcriptional changes in Escherichia coli upon treatment with (-)-roemerine
Sarıyar Akbulut B. (Danışman), MERTOĞLU B. (Eş Danışman)
D.AYYILDIZ(Öğrenci)
2015
2015Doktora
Understanding the response of bacteria to plant origin antimicrobial alkaloid (-)-roemerine using biosystem engineering tools
Sarıyar Akbulut B. (Danışman)
N.BÜDEYRİ(Öğrenci)
2013
2013Yüksek Lisans
Investigation of bioprocess operational parameters for phenol removal from wastewater discharges by Halomonas sp. AAD12
Sarıyar Akbulut B. (Danışman)
B.AYAN(Öğrenci)
2013
2013Yüksek Lisans
Effect of temperature on osmolyte regulation strategy using engineering tools
Sarıyar Akbulut B., SAYAR N. A. (Danışman)
H.MANGAOĞLU(Öğrenci)
2012
2012Yüksek Lisans
Evaluation of the antimicrobial activity of berberine
Sarıyar Akbulut B. (Danışman)
K.KARAOSMANOĞLU(Öğrenci)
2012
2012Yüksek Lisans
Understanding the membrane penetration of antimicrobial peptides
SARIYAR AKBULUT B. (Danışman)
B.ALAYBEYOĞLU(Öğrenci)
2012
2012Yüksek Lisans
Effect of simultaneous beta-lactamase inhibitor protein expression on cellular beta-lactamase activity
SARIYAR AKBULUT B. (Danışman)
K.SİMAY(Öğrenci)
2012
2012Yüksek Lisans
Beta-lactamase ligand recognition
SARIYAR AKBULUT B. (Danışman)
D.MENEKŞEDAĞ(Öğrenci)
2011
2011Yüksek Lisans
Investigation of penetration of inhibitor into cells and their interactions with intracellular proteins/metabolites
Sarıyar Akbulut B.
G.BULDUM(Öğrenci)
2011
2011Yüksek Lisans
Beta-lactamase binding to BLIP and BLIP based peptides
SARIYAR AKBULUT B. (Danışman)
A.DOĞAN(Öğrenci)
2011
2011Yüksek Lisans
Microbial adaptation to stress conditions using an integrative modelling and experimental approach
Sarıyar Akbulut B. (Danışman)
G.YILAN(Öğrenci)
2010
2010Yüksek Lisans
Investigation of in-vivo inhibition of ßeta-lactamase by ßeta-lactamase inhibitor protein
SARIYAR AKBULUT B. (Danışman)
A.EZGİ(Öğrenci)
2010
2010Yüksek Lisans
TEM-1 ß-lactamase activity in the presence of BLIP in cellular environments
SARIYAR AKBULUT B. (Danışman)
C.CEYLAN(Öğrenci)
2009
2009Yüksek Lisans
Investigation of peptide inhibitor binding to ß-lactamase
Sarıyar Akbulut B.
N.BÜDEYRİ(Öğrenci)
2009
2009Yüksek Lisans
Investigation of pertide inhibitor binding to ß-Lactamamase
SARIYAR AKBULUT B. (Eş Danışman), Akbulut B.(Eş Danışman)
N.Büdeyri(Öğrenci)
Makaleler
Tümü (59)
SCI-E, SSCI, AHCI (57)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (57)
Scopus (57)
TRDizin (4)
Diğer Yayınlar (1)
2025
20251. Production of the terpenoid-based biofuel α-bisabolene by metabolically engineered Corynebacterium glutamicum
Atas Erden B., Seeger J., Avci F. G., Wendisch V. F., SARIYAR AKBULUT B.
World Journal of Microbiology and Biotechnology
, cilt.41, sa.10, 2025 (SCI-Expanded)
2025
20252. Antivirulence therapy: type IV pilus as a druggable target for bacterial infections
Basaran E., Avci F. G., Ozcan A., Kula C., Ben Ali Hassine S., Keskin O., et al.
Medicinal Chemistry Research
, cilt.34, sa.2, ss.285-300, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20253. Exploring the coupling of dynamic residues in TEM-1 β-lactamase and their role in activity
Avci F. G., Vardar Ulu D., Atas Erden B., ALTINIŞIK KAYA F. E., Ozkan S. B., SARIYAR AKBULUT B.
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, 2025 (SCI-Expanded)
2025
20254. Tailoring Corynebacterium glutamicum for Sustainable Biomanufacturing: From Traditional to Cutting-Edge Technologies
Kurpejović E., SARIYAR AKBULUT B., Avci F. G.
Molecular Biotechnology
, 2025 (SCI-Expanded)
2025
20255. De novo production of eumelanin in a fermentative process with Corynebacterium glutamicum
Kurpejović E., Karcioglu C., Abdullahoglu E., SAYAR N. A., Wendisch V. F., SARIYAR AKBULUT B.
Biocatalysis and Biotransformation
, cilt.43, sa.3, ss.266-279, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20256. Attenuation of Type IV pili activity by natural products
Yalkut K., Ben Ali Hassine S., Basaran E., KULA C., Ozcan A., Avci F. G., et al.
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, cilt.43, sa.12, ss.5719-5729, 2025 (SCI-Expanded)
2024
20247. Development of a novel process towards an L-malate biorefinery using methanol as feedstock
Bastem G. M., SAYAR N. A., Brito L. F., Brautaset T., Virant D., SARIYAR AKBULUT B.
Chemical Engineering Research and Design
, cilt.212, ss.158-167, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20248. Utilization of orange peel waste for sustainable amino acid production by Corynebacterium glutamicum
Junker N., SARIYAR AKBULUT B., Wendisch V. F.
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
, cilt.12, 2024 (SCI-Expanded)
2023
20239. A two-step purification platform for efficient removal of Fab-related impurities: A case study for Ranibizumab
Tatli O., Oz Y., Dingiloglu B., Yalcinkaya D., Basturk E., Korkmaz M., et al.
Heliyon
, cilt.9, sa.11, 2023 (SCI-Expanded)
2023
202310. Piperidine-based natural products targeting Type IV pili antivirulence: A computational approach
Ozcan A., Keskin O., Sariyar Akbulut B., Özbek Sarica P.
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING
, cilt.119, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202311. Metabolic engineering of Corynebacterium glutamicum for L-tyrosine production from glucose and xylose
Kurpejović E., Burgardt A., Bastem G. M., Junker N., Wendisch V. F., SARIYAR AKBULUT B.
Journal of Biotechnology
, cilt.363, ss.8-16, 2023 (SCI-Expanded)
2023
202312. Valorization of hazelnut husk as a carbon source for L-DOPA production with Corynebacterium glutamicum
Pakalın B., Kurpejović E., Bastem G. M., SAYAR N. A., Wendisch V. F., Akbulut B.
Biochemical Engineering Journal
, cilt.190, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202313. A review on the mechanistic details of OXA enzymes of ESKAPE pathogens
Avci F. G., Tastekil I., Jaisi A., ÖZBEK SARICA P., SARIYAR AKBULUT B.
PATHOGENS AND GLOBAL HEALTH
, cilt.117, sa.3, ss.219-234, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202214. Can DapC be the missing aminotransferease in the arogenate route of L-tyrosine biosynthesis in Corynebacterium glutamicum?
ALTINIŞIK KAYA F. E., Kurpejovic E., Burgardt A., Wendisch V. F., SARIYAR AKBULUT B.
FEBS OPEN BIO
, cilt.12, ss.180-181, 2022 (SCI-Expanded)
2022
202215. Curcumin Displays Enhanced Solubility and Antibacterial Activities When Complexed with the Cell Penetrating Peptide pVEC
Koleoglu E., Acar T., DERMAN S., SARIYAR AKBULUT B.
INTERNATIONAL JOURNAL OF PEPTIDE RESEARCH AND THERAPEUTICS
, cilt.28, sa.4, 2022 (SCI-Expanded)
2022
202216. Carvacrol Enhances the Antimicrobial Potency of Berberine in Bacillus subtilis
Atas B., Aksoy C. S., Avci F. G., SAYAR N. A., Ulgen K., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E., et al.
CURRENT MICROBIOLOGY
, cilt.79, sa.5, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202217. Curvularia lunata: A fungus for possible berberine transformation
Yılmaz D., AVCI F. G., SARIYAR AKBULUT B.
International Journal of Secondary Metabolite
, cilt.9, sa.1, ss.66-73, 2022 (Scopus)
2021
202118. Tyrosinase-based production of L-DOPA by Corynebacterium glutamicum
Kurpejovic E., Wendisch V. F., SARIYAR AKBULUT B.
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
, cilt.105, sa.24, ss.9103-9111, 2021 (SCI-Expanded)
2021
202119. Live Cell Imaging of Peptide Uptake Using a Microfluidic Platform
Yuce M., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E., SARIYAR AKBULUT B., Ulgen K.
INTERNATIONAL JOURNAL OF PEPTIDE RESEARCH AND THERAPEUTICS
, cilt.27, ss.2003-2013, 2021 (SCI-Expanded)
2020
202020. Potentiating the activity of berberine for Staphylococcus aureus in a combinatorial treatment with thymol
Aksoy C. S., Avci F. G., Ugurel O. M., Atas B., SAYAR N. A., Akbulut B.
MICROBIAL PATHOGENESIS
, cilt.149, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202021. Identification of novel inhibitors of the ABC transporter BmrA
Serçinoğlu O., Senturk D., Altinisik K., Avci F., Frlan R., Tomašič T., et al.
BIOORGANIC CHEMISTRY
, cilt.105, 2020 (SCI-Expanded)
2019
201922. Techno-economic analysis of caffeine and catechins production from black tea waste
SAYAR N. A., DURMAZ ŞAM S., PİNAR O., Serper D., SARIYAR AKBULUT B., KAZAN D., et al.
Food And Bioproducts Processing
, cilt.118, ss.1-12, 2019 (SCI-Expanded, Scopus)
2019
201923. Repurposing bioactive aporphine alkaloids as efflux pump inhibitors
Avci F. G., Atas B., Aksoy C. S., Kurpejovic E., Toplan G. G., GÜRER Ç., et al.
FITOTERAPIA
, cilt.139, 2019 (SCI-Expanded)
2019
201924. A method for the quantitative determination of glycerophospholipid regioisomers by UPLC-ESI-MS/MS
Wozny K., Lehmann W. D., Wozny M., SARIYAR AKBULUT B., Bruegger B.
ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY
, cilt.411, sa.4, ss.915-924, 2019 (SCI-Expanded)
2018
201825. What Are the Multi-Omics Mechanisms for Adaptation by Microorganisms to High Alkalinity? A Transcriptomic and Proteomic Study of a Bacillus Strain with Industrial Potential
ALTINIŞIK KAYA F. E., Avci F. G., SAYAR N. A., KAZAN D., SAYAR A. A., SARIYAR AKBULUT B.
OMICS-A JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY
, cilt.22, sa.11, ss.717-732, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
2018
201826. Retro-techno-economic evaluation of acetic acid production using cotton stalk as feedstock
SAYAR N. A., KAZAN D., PİNAR O., SARIYAR AKBULUT B., SAYAR A. A.
JOURNAL OF MATERIAL CYCLES AND WASTE MANAGEMENT
, cilt.20, sa.4, ss.2077-2088, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
2018
201827. Membrane Active Peptides and Their Biophysical Characterization
Avci F. G., SARIYAR AKBULUT B., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E.
BIOMOLECULES
, cilt.8, sa.3, 2018 (SCI-Expanded)
2018
201828. Targeting a hidden site on class A beta-lactamases
Avci F. G., ALTINIŞIK KAYA F. E., Karacan I., Karagoz D. S., Ersahin S., Eren A., et al.
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING
, cilt.84, ss.125-133, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
2018
201829. pVEC hydrophobic N-terminus is critical for antibacterial activity
ALAYBEYOĞLU B., SARIYAR AKBULUT B., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E.
Journal Of Peptide Science
, cilt.24, ss.3083, 2018 (SCI-Expanded)
2018
201830. An OMIC approach to elaborate the antibacterial mechanisms of different alkaloids
Avci F. G., SAYAR N. A., Akbulut B.
PHYTOCHEMISTRY
, cilt.149, ss.123-131, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
2017
201731. Transcriptomic analysis displays the effect of (-)-roemerine on the motility and nutrient uptake in Escherichia coli
Ayyildiz D., ARĞA K. Y., Avci F. G., ALTINIŞIK KAYA F. E., Gurer C., Toplan G. G., et al.
CURRENT GENETICS
, cilt.63, sa.4, ss.709-722, 2017 (SCI-Expanded)
2017
201732. Response of Escherichia coli to Prolonged Berberine Exposure
Gokgoz N. B., Avci F. G., Yoneten K. K., Alaybeyoglu B., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E., SAYAR N. A., et al.
MICROBIAL DRUG RESISTANCE
, cilt.23, sa.5, ss.531-544, 2017 (SCI-Expanded, Scopus)
2017
201733. The effect of a beta-lactamase inhibitor peptide on bacterial membrane structure and integrity: a comparative study
Alaybeyoglu B., ULUOCAK B. B., SARIYAR AKBULUT B., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E.
JOURNAL OF PEPTIDE SCIENCE
, cilt.23, sa.5, ss.374-383, 2017 (SCI-Expanded)
2016
201634. An evolutionarily conserved allosteric site modulates beta-lactamase activity
Avci F. G., ALTINIŞIK KAYA F. E., Vardar Ulu D., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E., SARIYAR AKBULUT B.
JOURNAL OF ENZYME INHIBITION AND MEDICINAL CHEMISTRY
, cilt.31, ss.33-40, 2016 (SCI-Expanded)
2016
201635. Insights into membrane translocation of the cell-penetrating peptide pVEC from molecular dynamics calculations
Alaybeyoglu B., SARIYAR AKBULUT B., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E.
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS
, cilt.34, sa.11, ss.2387-2398, 2016 (SCI-Expanded)
2015
201536. Proteomics Evidence for the Activity of the Putative Antibacterial Plant Alkaloid (-)-Roemerine: Mainstreaming Omics-Guided Drug Discovery
Gokgoz N. B., SARIYAR AKBULUT B.
OMICS-A JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY
, cilt.19, sa.8, ss.478-489, 2015 (SCI-Expanded)
2015
201537. Moderately Halophilic Bacterium Halomonas. sp. AAD12: A promising candidate as a Hydroxyectoine Producer
Öztürk H. Ü., Sarıyar Akbulut B., Ayan B., Poli A., Denizci A. A., Utkan G., et al.
J Microb Biochem Technol , cilt.7, ss.262-268, 2015 (Hakemli Dergi)
2015
201538. A novel chimeric peptide with antimicrobial activity
Alaybeyoglu B., SARIYAR AKBULUT B., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E.
JOURNAL OF PEPTIDE SCIENCE
, cilt.21, sa.4, ss.294-301, 2015 (SCI-Expanded)
2015
201539. Investigation of the in vivo interaction between beta-lactamase and its inhibitor protein
Budeyri Gokgoz N., Yalaz S., Avci N. G., BULDUM G., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E., SARIYAR AKBULUT B.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
, cilt.39, sa.3, ss.485-492, 2015 (SCI-Expanded)
2014
201440. The importance of a conserved residue of the H10 helix in beta-lactamase
Avci F. G., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E., SARIYAR AKBULUT B.
NEW BIOTECHNOLOGY
, cilt.31, 2014 (SCI-Expanded)
2014
201441. Assessment of Berberine as a Multi-target Antimicrobial: A Multi-omics Study for Drug Discovery and Repositioning
Karaosmanoglu K., SAYAR N. A., KURNAZ I., SARIYAR AKBULUT B.
OMICS-A JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY
, cilt.18, sa.1, ss.42-53, 2014 (SCI-Expanded, Scopus)
2012
201242. Adaptive changes in the lipid distribution of a moderately halophilic microorganism under salt stress
Ozturk H. U., Ozturk N. C., Poli A., Nicolaus B., Ayan B., Denizci A. A., et al.
NEW BIOTECHNOLOGY
, cilt.29, 2012 (SCI-Expanded)
2012
201243. Osmoadaptation of a moderately halophilic microorganisms under cold stress
Ayan B., SARIYAR AKBULUT B., Poli A., Ozturk U., Ozturk N. C., Denizci A. A., et al.
NEW BIOTECHNOLOGY
, cilt.29, 2012 (SCI-Expanded)
2012
201244. Production of industrial enzymes for feed industry
Sogut M. S., Ozturk N. C., Ozturk H. U., Pinar O., Ipek F. M., Cayir E., et al.
NEW BIOTECHNOLOGY
, cilt.29, 2012 (SCI-Expanded)
2012
201245. Purification and characterization of a thermo and acid-stable endo-1,3-1,4-beta-glucanase from Bacillus amyliquefaciens YMNg47
DUMAN Y., KORKMAZ GÜVENMEZ H., ARIKAN B., DİNÇER S., Denizci A. A., SARIYAR AKBULUT B., et al.
NEW BIOTECHNOLOGY
, cilt.29, 2012 (SCI-Expanded)
2012
201246. Interplay of adaptive capabilities of Halomonas sp AAD12 under salt stress
Ceylan S., Yılan G., Sarıyar Akbulut B., Poli A., Kazan D.
JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
, cilt.114, ss.45-52, 2012 (SCI-Expanded)
2012
201247. Thermostable alpha-amylase from moderately halophilic Halomonas sp AAD21
Uzyol K. S., SARIYAR AKBULUT B., Denizci A. A., KAZAN D.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
, cilt.36, sa.3, ss.327-338, 2012 (SCI-Expanded)
2011
201148. Proteomic insight into phenolic adaptation of a moderately halophilic Halomonas sp strain AAD12
Ceylan S., SARIYAR AKBULUT B., Denizci A. A., Kazan D.
CANADIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY
, cilt.57, sa.4, ss.295-302, 2011 (SCI-Expanded)
2010
201049. Proteomic response of Escherichia coli to the alkaloid extract of Papaver polychaetum
Ozbalci C., Ünsal C., KAZAN D., SARIYAR AKBULUT B.
ANNALS OF MICROBIOLOGY
, cilt.60, sa.4, ss.709-717, 2010 (SCI-Expanded)
2010
201050. Cellular distribution of activity for three enzymes with maltose binding protein as fusion partner and the structural implications
Utkur O. F., SARIYAR AKBULUT B., Hortacsu A.
TURKISH JOURNAL OF CHEMISTRY
, cilt.34, sa.1, ss.1-13, 2010 (SCI-Expanded)
2009
200951. Dynamic Analysis of Beta-lactamase Ligand Recognition
Kanlikilicer P., Budeyri N., SARIYAR AKBULUT B., Hortacsu A., ÖZKIRIMLI ÖLMEZ E.
BIOPHYSICAL JOURNAL
, cilt.96, sa.3, 2009 (SCI-Expanded)
2009
200952. Rapid differentiation of new isolates with MALDI TOF mass spectrometry via discriminant function analysis based on principal components
SARIYAR AKBULUT B.
Korean J. Chem. Eng.
, cilt.26, ss.1645-1651, 2009 (SCI-Expanded)
2009
200953. Discriminant Function Analysis Based on Principal ComponentsforRapid Discrimination of Metabolic Capabilities of New Isolates
SARIYAR AKBULUT B.
Chem. Biochem. Eng. Q. , cilt.24, ss.119-127, 2009 (SCI-Expanded)
2008
200854. Preliminary phenotypic characterization of newly isolated halophilic microorganisms by footprinting: a rapid metabolome analysis
Sariyar-Akbulut B., Salman-Dilgimen A., Ceylan S., Perk S., Denizci A. A., Kazan D.
ARCHIVES OF MICROBIOLOGY
, cilt.189, sa.1, ss.19-26, 2008 (SCI-Expanded)
2006
200655. Monte Carlo sampling and principal component analysis of flux distributions yield topological and modular information on metabolic networks
Sariyar B., Perk S., Akman U., Hortacsu A.
JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY
, cilt.242, sa.2, ss.389-400, 2006 (SCI-Expanded)
2005
200556. Metabolic flux analysis of recombinant protein overproduction in Escherichia coli
Özkan P., SARIYAR AKBULUT B., Ütkür Ö., AKMAN Ş. U., Hortacsu A.
Biochemical Engineering Journal
, cilt.22, ss.167-195, 2005 (SCI-Expanded)
2004
200457. Expression and translocation of glucose isomerase as a fusion protein in E coli
SARIYAR AKBULUT B., Özkan P., Kırdar B., Hortacsu A.
Enzyme And Microbial Technology
, cilt.35, ss.105-112, 2004 (SCI-Expanded)
2004
200458. Mathematical modelling of Sec pathway mechanism in Escherichia coli a case study for periplasmic translocation of maltose binding protein glucose isomerase fusion protein
SARIYAR AKBULUT B., Hortaçsu A.
Chemical Engineering Science
, cilt.59, ss.1027-1038, 2004 (SCI-Expanded)
2002
200259. Metabolic Engineering through Cofactor Manipulation and Its Effects on Metabolic Flux Redistribution in Escherichia coli
Ka Y. S., George N B., Susana J B., Ravi V V., YeaTyng Y., Horton E., et al.
Metabolic Engineering
, cilt.4, ss.182-192, 2002 (SCI-Expanded)
Kitaplar
2021
20211. Antibacterial and antifungal activities of isoquinoline alkaloids of the Papaveraceae and Fumariaceae families and their implications in structure–activity relationships
AVCI F. G., ATAŞ B., GÜLSOY TOPLAN G., GURER Ç., SARIYAR AKBULUT B.
Studies in Natural Products Chemistry, Atta-ur-Rahman, Editör, Elsevier, ss.87-118, 2021
2020
20202. Antibiyotik Üretimi
Avci F. G., Sayar N. A., Sariyar Akbulut B.
Fermente Ürünler Teknolojisi ve Mikrobiyolojisi, Erkmen,Osman; Erten,Hüseyin,Sağlam,Hidayet, Editör, Nobel Akademik Yayıncılık, Ankara, ss.721-738, 2020
2012
20123. Protein İzolasyonu ve Analizi
Sarıyar Akbulut B., Kazan D.
Moleküler Üroloji, Türkeriü L.N.,Özer,Aç,Narter,F, Editör, Pelin Offset, Ankara, ss.583-597, 2012
2012
20124. Protein-Peptide Interactions Revolutionize Drug Development
Sarıyar Akbulut B., Özkırımlı Ölmez E.
Binding Protein, Ktob Abdelmohsen, Editör, InTech, Rijeka, ss.49-72, 2012
Desteklenen Projeler
2025 - 2027
2025 - 2027
Antibiyotiklerin Atıksulardan Giderimi için PNC ile Modifiye Edilmiş Selüloz ve Lignin Tabanlı Biyopolimerlerin Geliştirilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
Hacıosmanoğlu G. G. (Yürütücü), Sarıyar Akbulut B., Yücesoy Z., Can Z. S., Kıran Yıldırım B., Semerci N., et al.
2023 - 2026
2023 - 2026Eskape Patojenlerinde Yaygın Bulunan D-Sınıfı Beta-Laktamazlara Karsı OrtakInhibitörlerin Belirlenmesi
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Özbek Sarıca P. (Yürütücü), Aksu M. B., Keskin Özkaya Z. Ö., Avcı F. G., Sarıyar Akbulut B.
2021 - 2024
2021 - 2024
Sürdürülebilir Biyoekonomi Için Gıda Ile Yarışan Sübstratların Metanol, CO2 ve Metilamin Ile Değiştirilmesi
TÜBİTAK Uluslararası Çoklu İşbirliği Projesi , ERA.NET Projesi
Sariyar Akbulut B. (Yürütücü), Sayar N. A., Özbek Sarica P.
2021 - 2024
2021 - 2024Rasyonel tasarım ile Corynebacterium glutamicum?un L-DOPA üretimi için bir mikrobiyal hücre fabrikasına dönüstürülmesi ve LDOPA üretim prosesinin gelistirilmesi
TÜBİTAK Uluslararası İkili İşbirliği Projesi , 2525 - Almanya Eğitim ve Araştırma Bakanlığı (BMBF) İkili İşbirliği Programı
Sariyar Akbulut B. (Yürütücü), Sayar N. A., Özbek Sarica P., Kazan D.
2020 - 2023
2020 - 2023Tip 4 pili protein kompleksinin inhibisyonu ve inhibisyon dinamiğinin karakterizasyonu
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü), Özbek Sarıca P., Avci F. G., Keskin Özkaya Z. Ö.
2020 - 2022
2020 - 2022
Peptidlerle ilişkili bağışıklık sistemi proteinlerinin çalışma mekanizmalarının aydınlatılması
Diğer Resmi Kurumlarca Desteklenen Proje
(Proje Özeti)
Özbek Sarıca P. (Yürütücü), Sarıyar Akbulut B.
2019 - 2020
2019 - 2020Beta-Laktamazda Allosterik Regülasyona Yönelik Gizli Ceplerin İlişkili Aminoasitler Aracılığıyla Belirlenmesi
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü)
2018 - 2020
2018 - 2020Timol ve karvakrolün Staphylococcus aureus için dışa atım pompa inhibitörü olarak değerlendirilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü)
2016 - 2020
2016 - 2020Biyobenzer Ranibizumab: Yerli Olarak Geliştirilmesi ve Üretilmesi
TÜBİTAK Projesi , 1007 - Kamu Kurumları Araştırma ve Geliştirme Projelerini D.P.
(Proje Özeti)
Kazan D. (Yürütücü), Sariyar Akbulut B., Pinar O.
2017 - 2019
2017 - 2019Aporfin sınıfına ait alkaloitlerin in vitro ve in siliko yöntemlerle farklı sınıflara ait ilaç atım pompalarına inhibitör olarak değerlendirilmeleri
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü), Özbek Sarıca P., Avci F. G.
2017 - 2018
2017 - 2018Metabolik Mühendisligi Yöntemlerini Kullanarak Corynebacterium Glutamicum Microorganizmasında L-Dopa Üretiminin Gelistirilmesi
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü), Sayar N. A.
2014 - 2017
2014 - 2017İnhibitör Antimikrobiyel Peptitlerin Hücre Içine Taşınım Mekanizmaları Ve Hücre Içi Lokalizasyonlarının Biyofiziksel Karakterizasyonu
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Sarıyar Akbulut B., Özkırımlı Ölmez E.(Yürütücü)
2014 - 2017
2014 - 2017Antimikrobiyal özelliğe sahip farklı alkaloitlerin hücre içi hedeflerinin gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ve mikrodizi teknolojileri ile belirlenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü), Sayar N. A.
2014 - 2017
2014 - 2017Antimikrobiyel Ajanların Etkisini Anlamak İçin Sistem Biyolojisi Yaklaşımı ile Birleştirilmiş OMİK Verilerin Analizi
TÜBİTAK Uluslararası İkili İşbirliği Projesi , 2527 - Almanya Eğt. ve Arş. Bakanlığı (BMBF) IntenC Programı
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü), Kazan D., Sayar N. A.
2013 - 2014
2013 - 2014Beta Laktamaz Alosterik Bölgesinin Ligand Tanıma Ve Bağlanmaya Etkisinin İncelenmesi
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü)
2010 - 2012
2010 - 2012Biyoteknolojik Uygulamalarda Doğal Ürün Kaynağı Ekstremofiller: Mühendislik Prensipleri İle Ozmoregülasyon Stratejilerinin İncelenmesi
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Sarıyar Akbulut B., Kazan D. (Yürütücü)
2009 - 2012
2009 - 2012İnhibitör Peptitlerin Hücre İçine Girmelerinin Ve Hücre İçi Enzimlere Etkilerinin Hesapsal Ve Deneysel Yöntemlerle Araştırılması
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Sarıyar Akbulut B., Özkırımlı Ölmez E.(Yürütücü)
2008 - 2012
2008 - 2012Yem Endüstrisine Yönelik Endüstriyel Enzimlerin Üretimi (Yem-En)
TÜBİTAK Projesi , 1007 - Kamu Kurumları Araştırma ve Geliştirme Projelerini D.P.
Sarıyar Akbulut B., Mandacı S.(Yürütücü), Pinar O., Kazan D.
2009 - 2011
2009 - 2011Biyosistem Mühendisliği Prensipleriyle Stres Koşullarındaki Metabolik Kapasitelerin İncelenmesi
TÜBİTAK Projesi , 3501 - Ulusal Genç Araştırmacı Kariyer Geliştirme Programı
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü)
2009 - 2010
2009 - 2010Beta-Laktamaza Yönelik Peptit Temelli Inhibitör Tasarımı Ve Incelenmesi
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
Sarıyar Akbulut B., Özkırımlı Ölmez E.(Yürütücü)
2005 - 2007
2005 - 2007Termostabil Glikoz İsomeraz Enziminin Bakteriyel Sec Ve Tat Mekanizmaları İle Hücre Dışına Taşınmasının İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü)
2003 - 2006
2003 - 2006
Türkiye'deki Bazı Aşırı Tuzlu Ortamlardan İzole Edilmiş Olan Halofilik ve Ekstrem Halofilik Arkeaların Tanılanması ve Proteaz Başta Olmak Üzere Ekstremozimlerin Araştırılması
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Sarıyar Akbulut B., Kazan D. (Yürütücü)
Etkinlik Organizasyonlarındaki Görevler
Haziran 2017
Haziran 2017FROM NETWORKS TO TARGETS Workshop on OMIC technologies and their applications
Çalıştay Organizasyonu
Sarıyar Akbulut B.
Türkiye