Metrikler
Biyografi
Sude Büyükkurt, 2017 yılında Marmara Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü’nde başladığı lisans eğitimini 2021 yılında tamamlamıştır. 2022 yılında aynı bölümde yüksek lisans eğitimine başlamış ve halen Marmara Üniversitesi Biyoloji Bölümü’nde araştırma görevlisi olarak görev yapmaktadır.
Araştırma alanları; membranların moleküler dinamik simülasyonları, antimikrobiyal peptitlerin bakteriyel zarlarla etkileşimlerinin hesaplamalı biyofiziksel yöntemlerle modellenmesi, protein-ligand bağlanma afinitelerinin serbest enerji hesaplamaları ve ilaç keşfi süreçlerinde kullanılan in silico yaklaşımlar üzerinedir.
2022–2024 yılları arasında Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu (TÜBİTAK) tarafından 2210/A Yurt İçi Lisansüstü Burs Programı kapsamında desteklenmiştir. 2025 yılında Marmara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi tarafından düzenlenen MÜEFKON'25 kongresinde sunduğu poster çalışması ile “Poster Ödülü” kazanmıştır.
Akademik gelişimini desteklemek amacıyla birçok ulusal ve uluslararası eğitim programına ve çalıştaya katılmıştır. Bunlardan bazıları şunlardır:
-
Molecular Dynamics Simulations of Transmembrane Proteins – Gebze Teknik Üniversitesi, 2022
-
The Drug Discovery Journey from Early Discovery to Clinical Trials – Clarivate Analytics, 2022
-
Virtual Screening and Ligand Design using Small-Molecule Drug Discovery Suite – Schrödinger Webinar Serisi, 2022
-
GROMACS/pmx for Large Scale Alchemical Protein-Ligand Binding Affinity Screening – Berlin, Almanya, 2022
-
Overview of Enamine’s Scientific Achievements – Kyiv, Ukrayna, 2022
-
Bilimsel ve Eğitim Makaleleri Nasıl Yazılır ve Yayımlanır? – TÜBİTAK, 2023
Çeşitli bilimsel kongrelerde bildirileriyle yer almıştır. Seçilmiş bildiriler:
-
Antimikrobiyal Peptitlerin Gram-Pozitif Bakteri Membranlarıyla Etkileşiminin Hesaplamalı Modellerle Değerlendirilmesi, MÜEFKON'25, İstanbul, 2025.
-
Computer-Aided Thermal Adaptation Studies on the Bacterial Enoyl-[acyl-carrier-protein] Reductase (FabI), III. Uluslararası Bilimsel Kongre, İstanbul, 2023.
-
Molecular Origins of Life, Münih, Almanya, 2021.
Sude Büyükkurt, bilimsel kariyerine hesaplamalı biyoloji ve yapısal biyoinformatik alanlarında odaklanarak devam etmekte ve moleküler düzeyde biyolojik süreçlerin anlaşılmasına katkıda bulunmayı amaçlamaktadır.
Eğitim Bilgileri
2022 - 2025
2022 - 2025Yüksek Lisans
Marmara Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Türkiye
2017 - 2021
2017 - 2021Lisans
Marmara Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Türkiye
Yabancı Diller
B2 Orta Üstü
B2 Orta Üstüİngilizce
Sertifika, Kurs ve Eğitimler
2023
2023Bilimsel Bir Makale Nasıl Yazılır ve Yayımlanır Eğitimi
Mesleki Eğitim
Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu
2022
2022Molecular Dynamics Simulations of Transmembrane Proteins Training Program
Mesleki Kurs
Gebze Teknik Üniversitesi
2022
2022Clarivate Metacore Eğitimi
Stratejik Teknoloji Analizi
Biruni Üniversitesi ve Trinity Dublin Üniversitesi
2022
2022The Drug Discovery Journey from Early Discovery to Clinical Trials
Sağlık ve Tıp
Clarivate Analytics
2022
2022Computer Aided Drug Discovery Symposium and Workshop
Sağlık ve Tıp
Biruni Üniversitesi
2022
2022Schrödinger‘s Webinar – Virtual Screening and Ligand Design using Small-Molecule Drug Discovery Suite
Veri Analizi
Biruni Üniversitesi
Araştırma Alanları
Yaşam Bilimleri
Biyoinformatik
Biyoenformasyon
Biyolojik Veritabanları
Temel Bilimler
Akademik Ünvanlar / Görevler
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam EdiyorAraştırma Görevlisi
Marmara Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü
Makaleler
2025
20251. Structural insights into the dynamics of anti-microbial peptides Temporin-1RNa and 1RNb, and derivatives in aqueous and octanol media
Albayrak Karahan E., Büyükkurt S., Mutlu Ö.
JOURNAL OF MOLECULAR LIQUIDS
, cilt.439, ss.128855-128867, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2025
20251. Antimikrobiyal Peptitlerin Gram-Pozitif Bakteri Membranlarıyla Etkileşiminin Hesaplamalı Modellerle Değerlendirilmesi
Büyükkurt S., Mutlu Ö.
Marmara Üniversitesi Ulusal Eczacılık Kongresi MÜEFKON’25, İstanbul, Türkiye, 8 - 10 Mayıs 2025, (Özet Bildiri)
2023
20232. Novel Anticancer Peptide Design; Computational Point of View
Albayrak-Karahan E., Büyükkurt S., Mutlu Ö.
9 TH INTERNATIONAL BAU DRUG DESIGN CONGRESS, İstanbul, Türkiye, 29 Kasım - 02 Aralık 2023, ss.127, (Özet Bildiri)
2021
20213. Computer-Aided Thermal Adaptation Studies on the Bacterial Enoyl-[acyl-carrier-protein] Reductase (FabI)
Büyükkurt S., Mutlu Ö.
Molecular Origins of Life, Munich, Munich, Almanya, 25 - 27 Ağustos 2021, (Özet Bildiri)
Ödüller
Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri
08 Mayıs 2025 - 10 Mayıs 2025
08 Mayıs 2025 - 10 Mayıs 2025Ulusal Eczacılık Kongresi (MÜEFKON’25)
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
29 Kasım 2023 - 02 Aralık 2023
29 Kasım 2023 - 02 Aralık 20239th INTERNATIONAL BAU DRUG DESIGN CONGRESS 2023
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
28 Haziran 2023 - 28 Haziran 2023
28 Haziran 2023 - 28 Haziran 2023CCPBioSim Industry Talk - Schrodinger
İzleyici / Dinleyici
London-İngiltere
11 Mayıs 2022 - 12 Mayıs 2022
11 Mayıs 2022 - 12 Mayıs 2022Computer Aided Drug Discovery Symposium
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
26 Nisan 2022 - 26 Nisan 2022
26 Nisan 2022 - 26 Nisan 2022BioExcel HPC Workflows: predictive power and its applications in pharmacology
Katılımcı
Gothenburg-İsveç
21 Nisan 2022 - 21 Nisan 2022
21 Nisan 2022 - 21 Nisan 2022Gromacs/pmx for large scale alchemical protein-ligand binding affinity screening
İzleyici / Dinleyici
Berlin-Almanya
17 Mart 2022 - 17 Mart 2022
17 Mart 2022 - 17 Mart 2022The Role of Enamine in the Era of “Digital Pharmacology”
İzleyici / Dinleyici
Kyyiv-Ukrayna
16 Mart 2022 - 22 Mart 2022
16 Mart 2022 - 22 Mart 2022Overview of Enamine’s Compound Libraries
İzleyici / Dinleyici
Kyyiv-Ukrayna
15 Mart 2022 - 15 Mart 2022
15 Mart 2022 - 15 Mart 2022Overview of Enamine’s Scientific Achievements
İzleyici / Dinleyici
Kyyiv-Ukrayna
Burslar
2022 - 2024
2022 - 2024