Arş. Gör. SUDE BÜYÜKKURT

Sude Büyükkurt, 2017 yılında Marmara Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü’nde başladığı lisans eğitimini 2021 yılında tamamlamıştır. 2022 yılında aynı bölümde yüksek lisans eğitimine başlamış ve halen Marmara Üniversitesi Biyoloji Bölümü’nde araştırma görevlisi olarak görev yapmaktadır.

Araştırma alanları; membranların moleküler dinamik simülasyonları, antimikrobiyal peptitlerin bakteriyel zarlarla etkileşimlerinin hesaplamalı biyofiziksel yöntemlerle modellenmesi, protein-ligand bağlanma afinitelerinin serbest enerji hesaplamaları ve ilaç keşfi süreçlerinde kullanılan in silico yaklaşımlar üzerinedir.

2022–2024 yılları arasında Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu (TÜBİTAK) tarafından 2210/A Yurt İçi Lisansüstü Burs Programı kapsamında desteklenmiştir. 2025 yılında Marmara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi tarafından düzenlenen MÜEFKON'25 kongresinde sunduğu poster çalışması ile “Poster Ödülü” kazanmıştır.

Akademik gelişimini desteklemek amacıyla birçok ulusal ve uluslararası eğitim programına ve çalıştaya katılmıştır. Bunlardan bazıları şunlardır:

• Molecular Dynamics Simulations of Transmembrane Proteins – Gebze Teknik Üniversitesi, 2022

• The Drug Discovery Journey from Early Discovery to Clinical Trials – Clarivate Analytics, 2022

• Virtual Screening and Ligand Design using Small-Molecule Drug Discovery Suite – Schrödinger Webinar Serisi, 2022

• GROMACS/pmx for Large Scale Alchemical Protein-Ligand Binding Affinity Screening – Berlin, Almanya, 2022

• Overview of Enamine’s Scientific Achievements – Kyiv, Ukrayna, 2022

• Bilimsel ve Eğitim Makaleleri Nasıl Yazılır ve Yayımlanır? – TÜBİTAK, 2023

Çeşitli bilimsel kongrelerde bildirileriyle yer almıştır. Seçilmiş bildiriler:

• Antimikrobiyal Peptitlerin Gram-Pozitif Bakteri Membranlarıyla Etkileşiminin Hesaplamalı Modellerle Değerlendirilmesi, MÜEFKON'25, İstanbul, 2025.

• Computer-Aided Thermal Adaptation Studies on the Bacterial Enoyl-[acyl-carrier-protein] Reductase (FabI), III. Uluslararası Bilimsel Kongre, İstanbul, 2023.

• Molecular Origins of Life, Münih, Almanya, 2021.

Sude Büyükkurt, bilimsel kariyerine hesaplamalı biyoloji ve yapısal biyoinformatik alanlarında odaklanarak devam etmekte ve moleküler düzeyde biyolojik süreçlerin anlaşılmasına katkıda bulunmayı amaçlamaktadır.