Türkiyede inflamatuar romatizmal hastalıklarda PTPN22 gen polimorfizmi varlığı
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Marmara Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Dahili Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2008
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: NİLÜFER ŞAHİN
Danışman: RAFİ HANER DİRESKENELİ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Giriş: Lenfoid tirozin fosfataz proteinini kodlayan PTPN22 geninde saptananfonksiyonel tek nükleotid polimorfizminin romatoid artrit (RA) ve tip 1 diabetesmellitus (DM) gibi otoimmün hastalıklara yatkınlık ile ilişkili olduğugösterilmiştir. Lenfoid tirozin fosfatazın T hücrelerinin aktivasyonunda roloynayan kinazlarla etkileştiği ve polimorfizmin bu etkileşimi aşırı yanıtlılıkyönünde değiştirdiği düşünülmektedir. PTPN22 R620W farklıpopülasyonlarda farklı alel frekanslarına sahiptir ve en yüksek frekansİskandinav ülkelerinde görülürken, Asya ve Afrika topluluklarında seyreksaptanmıştır. Bu araştırmada Türkiye'de RA, Takayasu arteriti (TA) veBehçet Hastalığı' nın (BH) PTPN22 R620W polimorfizmi ile ilişkisiaraştırılmıştır.Gereç-Yöntem: Çalışma kapsamında RA'lı 167 hasta (25 erkek/142 kadın,ortalama yaş: 52.1±11.7), TA'lı 181 hasta (19 erkek/162 kadın, ort. yaş:37±11.7), BH'lı 134 hasta (71 erkek/63 kadın, ort. yaş: 32.8±9.7) ve 177sağlıklı kontrol (86 erkek/91 kadın, ort. yaş: 40.6 ± 9.7) yer aldı. PTPN22 genpolimorfizmi (rs2476601, A/G) PCR-RFLP yöntemi ile genotiplendirildi.Polimorfik bölge PCR ile çoğaltılıp XcmI enzimi ile parçalandı. Genotipdağılımları gruplar arasında k-kare ile karşılaştırıldı.Bulgular: Heterozigot genotip (AG) frekansı kontrol grubunda % 5.1 (9/177),RA' da % 6.6 (11/167) ve TA' da % 3.8 (7/181) olarak saptandı. RA, TA vekontrol grupları arasında istatistiksel olarak anlamlı fark saptanmadı (RA: p=0.55, OR: 1.3, 95% CI: 0.53-3.26 ve TA: p= 0.61, OR: 0.75, 95% Cl: 0.3-2.0).BH grubunda ise PTPN22 gen polimorfizmine hiç rastlanmadı (p= 0.012, OR:0.65, 95% CI: 0.0-1.1). Hiçbir grupta homozigot polimorfik genotip görülmedi.Tartışma ve sonuçlar: Çalışmamızda PTPN22 polimorfizminin Türkiye'deRA ve TA ile ilişkili olduğu gösterilememiştir. Daha önce yapılan çalışmalardaRA'da HLA-DR ?ortak epitop? alelleri ile ilişkinin diğer popülasyonlara benzerbulunmasına karşın PTPN22 polimorfizmi ile ilişki görülmemesi PTPN22polimorfizminin Asya ülkelerinde olduğu gibi Türkiye'de de çok düşükfrekanslı olmasına bağlanabilir. BH'da ise bu polimorfizmin bulunmamasıkoruyucu bir rolü düşündürebilir.ANAHTAR SÖZCÜKLER: PTPN22 geni, romatoid artrit, Takayasu arteriti,Behçet hastalığı, tek nükleotid polimorfizmi