Çoklu Aromatik Organik Bileşiklerin Sentezi Ve Biyofilm Engelleyici Etkilerinin İncelenmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Marmara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Fakültesi, Temel Sağlık Bilimleri Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2024

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Kübra Yeşilkaya

Danışman: Gökçe Merey

Özet:

Bakterilerin, kendilerini korumak ve üremelerini kolaylaştırmak için oluşturdukları polisakkarit yapılı biyofilm tabakası, dezenfeksiyonu zorlaştıran önemli bir faktördür. Bununla birlikte, özellikle patojen bakterilerin oluşturduğu biyofilm tabakaları, hastane enfeksiyonlarının yaygınlaşmasına ve gıda endüstrisinde ürünlerin işlenmesinde problem oluşmasına sebep olmaktadır. Bakterilerde biyofilm oluşumunu kontrol eden mekanizmadan sorumlu molekülün dimerik formda halkalı guanozin monofosfat (c-di- GMP) olduğu bilinmektedir.  Molekül yapısı incelendiğinde c-di-GMP, yapısında bulunan dimerik formdaki guanozin grupları nedeniyle akridin gibi çoklu aromatik yapılar varlığında cis formda dört katlı (quadruplex) ve sekiz katlı (octaplex) yapılar oluşturabilmekte ve aktivitesi sonlanmaktadır.  Gerçekleştirilen tez çalışmasında amaç, bakteriyel biyofilm tabakalarının oluşumunu engellemek üzere c-di-GMP aktivitesini engelleme potansiyeli taşıyan çoklu aromatik bileşikler sentezlemek ve bunların biyofilm engelleme potansiyellerini araştırmaktır.  

Gereç ve Yöntem: Çalışmada c-di-GMP, özellikle gıda güvenliğini tehdit eden bakteriler olan Escherichia coli ve Campylobacter jejuni’den izole edilmiştir. Çoklu aromatik organik bileşikler olarak borondiflorür azadipirometen (Aza-BODIPY, Örnek 1) ve çoklu aromatik yapıda üç farklı piren türevi bileşik (Örnek 2-4) kullanılmıştır. Örneklerin bakterilerden izole edilen c-di-GMP ile etkileşimlerinin incelenmesi UV spektroskopisi ile gerçekleştirilmiştir.

Bulgular:  UV spektroskopisi sonuçlarına göre c-di-GMP’nin 254 ve 302 nm’deki kendine özgü absorpsiyonlarında anlamlı azalma gösteren bileşikler, Örnek 1 ve 2 olmuştur. Örnek 4 hiç etkileşime girmemiş, Örnek 3 ise çok düşük oranda etkileşmiştir. Etkileşen ve etkileşmeyen moleküllerin yapısı incelendiğinde etkileşen moleküllerde elektron çekici grup bulunmadığı gözlenmektedir. Bundan sonraki çalışmalar için bu durum göz önünde bulundurulmalıdır.

Sonuçlar: Uygun yapıda çoklu organik bileşikler c-di-GMP ile etkileşebilmektedir. Dolayısıyla özellikle sağlık ve gıda alanında biyogüvenlik açısından tehdit oluşturan biyofilm oluşumunu engelleme potansiyelleri bulunmaktadır.