Akademik Veri Yönetim Sistemi
1. Ulusal Tıbbi Mikoloji Sempozyumu, İzmir, Türkiye, 26 - 27 Nisan 2013, ss.1-2
Giriş
Sistemik mantar enfeksiyonlarına yol açan etkenlerin
tür düzeyinde, doğru ve erken tanımlanması tedavi
açısından büyük öneme sahiptir. Bu amaçla pek çok
laboratuvarda yaygın bir yöntem olarak API-ID32C sistemi
kullanılmaktadır. Son yıllarda klinik örneklerden izole edilen
bakteri ve mayaların hızlı tanımlanması amacıyla ‘Matrixassisted
laser desorption time of flight- mass spectrometry
(MALDI-TOF-MS) yöntemi de bazı merkezlerde kullanılmaya
başlanmıştır.
Amaç
Bu çalışmada; 2002-2012 yılları arasında çeşitli klinik
örneklerden etken olarak izole edilmiş ve API-ID-
32C(bioMérieux) kiti ile tanımlanmış olan 160 adet kandida
kökeninin, (MALDI-TOF-MS/VITEK-MS bioMérieux) yöntemi
ile tekrar tanımlanması ve sonuçların altın standart
26SrDNA dizi analizi (RefGen/Ankara) metodu ile
karşılaştırılması amaçlanmıştır.
Materyal Metod
API-ID-32C kiti ile tanımlanmış olan 160 adet kandida
izolatının, C.albicans ATCC-90018 ve C.parapsilosis ATCC-
22019 standart kökenlerinin; ticari kit kullanılarak DNA
ekstraksiyonu ve 26S rDNA bölgesinin NL1/NL4 bölgelerine
spesifik primerler ile elde edilen PCR ürünlerine dayalı dizi
analizleri yapıldı. Aynı kökenler MALDI-TOF-MS sistemi ile
tanımlandı ve sonuçlar karşılaştırıldı.
Sonuç
1. Bir köken dışında, ‘159/160’ klinik izolatın ve iki adet
ATCC kökeninin; API-ID32C kiti ve MALDI-TOF-MS
sistemi ile tanımlama sonuçları, her iki yöntemle ve altın
standart metod 26S rDNA dizi analizi ile %100 uyumlu
olarak belirlenmiştir. (Tablo-1)
2. Rutin hizmet veren klinik laboratuvarlarda; çalıştığımız
türler bazında, API-ID32C kitinin ya da sistem kurulmuş ise
daha hızlı ve daha ucuz maliyetle sonuç veren MALDI-TOFMS
sisteminin güvenilirlikle uygulanabileceğini önerebiliriz.