34. Ulusal Kimya Kongresi, Yalova, Türkiye, 1 - 06 Eylül 2022, ss.318-319
Nitrik oksit (NO), gaz
halinde bulunan bir sinyal molekülüdür. Nitrik oksit sentazlar (NOS) ise, arjininden
nitrik oksit sentezleyen enzimlerdir. Nitrik oksit sentazın (NOS) insanda 3
izoformu bulunmaktadır. Bunlardan
nöronal nitrik oksit sentaz (nNOS) ve endotelyal nitrik oksit sentaz (eNOS) NO
üretimi üzerinde etkili iken, indüklenebilir nitrik oksit sentaz (iNOS) ise
patojenlere karşı bağışıklık işlemlerinde etkili olurlar.
Bu üç enzimde birbirine
çok yakın bir yapıya sahiptir. Bu yüzden seçimli inhibitörlerin
belirlenebilmesi için farklı ligandlar kullanılarak enzimlerin aktif
bölgelerindeki farkları incelemek gerekmektedir. Nöronal nitrik oksit
sentazın seçimli inhibisyonu, sinir sistemi üzerinde etkili olan Parkinson ve
Alzheimer gibi hastalıklara karşı umut verici tedavi yaklaşımı olarak ortaya
çıkmaktadır.
Kumarinler, 1,2-benzopiron
(C9H6O2) olarak karakterize edilen ve yaygın
olarak bitkilerde bulunan doğal ürünlerdir. Ayrıca, bitkiler dışında sentetik
olarak üretilmekte olup, bazı bakteri ve mantar türlerinde bulunurlar. Kumarinler,
geniş bir yelpazede farklı farmakolojik özellikler göstermektedir. Literatürde
kumarin türevlerinin; anti-koagülanlar, anti-HIV ajanları, anti-oksidanlar,
anti-tümörler ve serbest radikal temizleyicileri olarak farmakolojik olarak
yararlı olduğu ve endüstriyel alanlarda geniş uygulamalara sahip olduğu
bilinmektedir.
Bu çalışmamızda çeşitli
kumarin bileşiklerin nitrik oksit sentaz izoenzimleri üzerindeki etkilerinin
moleküler doking yoluyla in siliko olarak incelenmiştir. Ayrıca bu
çalışmada kullanılan kumarin bileşiklerinin Emilim, Dağılım, Metabolizma ve
Atılım (ADME) özellikleri ve Lipinski 5 kuralına uygunluğu da araştırılmıştır.
Bu duruma uygun olan kumarin bileşikleri protein veri bankasından indirilen
enzimlerle moleküler doking çalışmaları gerçekleştirilmiş ve bu enzimlere
bağlanma durumları incelenmiştir. Moleküler doking sonucunda nNOS enzimine
bağlanma afinitesi güçlü olan kumarin türevleri ileride Parkinson ve Alzheimer
gibi sinir sistemini etkileyen hastalıklara karşı yeni ilaçların geliştirilmesinde
katkıda bulunabileceği düşünülmektedir.