Peptidlerle ilişkili bağışıklık sistemi proteinlerinin çalışma mekanizmalarının aydınlatılması


Özbek Sarıca P. (Executive) , Sarıyar Akbulut B.

Project Supported by Other Official Institutions, 2020 - 2022

  • Project Type: Project Supported by Other Official Institutions
  • Begin Date: April 2020
  • End Date: February 2022

Project Abstract

Proje kapsamında, sistematik bir çerçevede HLA (İnsan Lökosit Antijenleri-Human Leukocyte Antigen) molekülleri ile sitotoksik T-hücre reseptörü (TCR) arasındaki bağlanma ve ilişkili bağışlık sistemi mekanizmalarını anlamaya yönelik hesapsal çalışmalarla allosteri ve bağlanma mekanizması konularına açıklık getirilmesi hedeflenmektedir.. Proje sonucunda elde edilecek bulgularla, proteinlerde allosterik mekanizmanın temel kavramları çerçevesinde çalışılmasına ve bu konuda bilgi birikiminin oluşturulmasına önemli katkılarda bulunulması beklenmektedir. Onkojenik peptidlerin TCR yapısına sunulması sırasındaki allosterik değişikliklerin tanımlanması ve diğer peptidlerden ayrıştırılması kanserin immunolojik arka planı konusunda yeni bir yaklaşım oluşturacaktır. Diğer bir deyişle, çıktıları değişik alanlara hitap eden bu proje TCR-pMHC etkileşimleri ve peptit aşılarının geliştirilmesi konularındaki bilgi birikimine önemli katkılar sağlayacak, ilaç dizaynı ve protein mühendisliği konularına da öngörüler sağlayabilecektir. Proje çerçevesinde geliştirilen yöntem ve analizler sonrasında da çeşitli güncel biyoloji ve sağlık problemlerinin çözümünde kullanılabilecektir. Bütçesi kapsamında üç bursiyer bulunmakta olup, konu ile ilgilenen yüksek lisans ve doktora öğrencilerimiz de desteklenmiş olacaktır.